GoOn – Semantische Rechercheplattform für die Lebenswissenschaften

Informationen zu Antikörpern mit semantischen Verfahren verstehen
Antikörper spielen in der modernen Pharmaforschung eine zunehmend wichtige Rolle, beispielsweise wenn es um die Markierung von Genen und Proteinen geht. Diese sind oftmals nicht einheitlich benannt und daher schwer einzuordnen. So hat von den ca. 500.000 bis 1 Million menschlichen Proteinspezies jedes im Durchschnitt 5 verschiedene Bezeichnungen und teilweise hunderte von Schreibweisen. Auch werden unterschiedliche Proteine oft mit dem gleichen Namen bezeichnet und müssen über den jeweiligen Kontext identifiziert werden. Das Ziel von GoOn ist es, diese Vielfalt zu ordnen und mit einer Spezialsuchmaschine das Auffinden von Informationen zu bestimmten Antikörpern zu erleichtern.

Die Vielfalt von Genen und Proteinen beherrschbar machen
Zusätzlich wird im Rahmen des Projekts GoOn eine semantische Plattform zur Entschlüsselung von Geninteraktionsnetzwerken entwickelt. Neuartige Verfahren sollen die Behandlung von bestimmten Krankheiten wie beispielsweise Bausspeicheldrüsenkrebs unterstützen, indem sie mit Hilfe von semantischen Technologien Wissen zu bekannten Interaktionen von Genen und Proteinen zusammentragen und ordnen. Neben bekannten Daten werden auch Texte aus verschiedenen Quellen analysiert, um so den Wirkmechanismus bestimmter Medikamente besser verstehen und optimieren zu können.

SMILA Infrastruktur für effektives Datenmanagement
GoOn nutzt Technologien aus der Open-Source Initiative SMILA. SMILA liefert die Infrastruktur für das Auffinden und Managen sehr großer Mengen an strukturierten und unstrukturierten Daten.